ميكروأري مقرها التهجين الجينومي المقارن (صفيف [ك]) بالكشف عن الحذف الكروموسومات دون المجهرية والازدواجية في المرضى الذين يعانون من صعوبات التعلم / الت

[رافت ابراهيم]

 

http://jmg.bmj.com/content/41/4/241.full

https://translate.googleusercontent....KuerPlgUX4LbnQ


ملخص

الأسباب الكامنة وراء العجز عن التعلم وتشوه الملامح في العديد من المرضى لا تزال مجهولة على الرغم من التحقيق واسعة النطاق. تحليل النمط النووي الروتيني ليست حساسة بما يكفي للكشف عن إعادة ترتيب الكروموسومات خفية (أقل من 5 ميغابايت). تم التحقيق وجود خفية تغييرات في عدد النسخ الحمض النووي عن طريق صفيف [ك] في 50 المرضى الذين يعانون من صعوبات التعلم وخلل البنية؛ شوهة، وتوظيف ميكروأري DNA شيدت من الحيوانات المستنسخة إدراج كبيرة متباعدة في ما يقرب من 1 ميغابايت فترات عبر الجينوم. وتم تحديد اثني عشر نسخة تشوهات العدد في 12 مريضا (24٪ من المجموع): سبعة الحذف (على ما يبدو من جديد واحدة ست الموروثة من أحد الوالدين الطبيعي ظاهريا) وخمسة الازدواجية (واحد من جديد وأربعة الموروثة من الآباء والأمهات العادي ظاهريا). وتراوحت شرائح تغيير في حجمها من تلك التي تنطوي على استنساخ واحد لمناطق كبيرة مثل 14 ميجا بايت. وقد تم تحديد أي حذف المتكرر أو الازدواجية داخل هذه الفئة من المرضى. على أساس هذه النتائج، ونحن نتوقع أن أن صفيف CGH تصبح طريقة روتينية للفحص الجينوم على نطاق لإعادة ترتيب متوازن في الأطفال الذين يعانون من صعوبات التعلم.
وكثيرا ما يرتبط اختلال الكروموسومات الدستوري مع العجز عن التعلم، خلل البنية؛ شوهة، التشوهات الخلقية، وتشوهات النمو. أمثلة من الاختلالات الكروموسومية المتكررة وتشمل الشروط جيدا اتسم مثل trisomies المشتركة، والتي يمكن دراستها من خلال تقنيات الوراثية الخلوية الكلاسيكية. ومع ذلك، فإن هذه الطرق دقة محدودة وغير موثوقة لإجراء تغييرات في عدد النسخ خفية تشمل قطاعات الكروموسوم من 5 ميجا بايت في طول أو أقل.
microdeletion الكروموسومات أو ازدواجية المتلازمات المتكررة، مثل على سبيل المثال متلازمة دي جورج (متلازمة حذف 22q11)، قد يكون سريريا التعرف عليها بسبب مزيج من المظاهر السريرية أو بسبب مظهر الوجه المميز ("الجشطالت"). في المرضى الذين يعانون من كروتب] طبيعية، قد المظاهر السريرية لا تزال تدل على المناطق المناسبة ليتم عرضه لاختلال التوازن المجهرية التي كتبها الفلورسنت تهجين الموقع (FISH) تحليل في استخدام موضع تحقيقات محددة. في كثير من الأحيان، ومع ذلك، فإن الجمع بين المظاهر السريرية ليس التشخيص من متلازمة معينة ولكن يمكن مع ذلك لا تزال تشير إلى أن الخلل الكروموسومي هو السبب المرجح الكامنة وراء الشذوذ. أعطت تحقيقات FISH تهدف إلى الكشف عن إعادة ترتيب subtelomeric العائد التشخيص كبير من حوالي 6٪ في المرضى الذين يعانون من صعوبات التعلم غير المبررة والميزات تشوه، 1- 3 ولكن الخلالي الحذف الكروموسومات والازدواجية لا يمكن اكتشافها باستخدام هذا الأسلوب.
وفي الآونة الأخيرة، تم تطبيق تقنية التهجين الجينومي المقارن ([ك]) باستخدام الكروموسومات الطورية لهذه المشكلة السريرية. 4، 5 وقد تم تنقيح حساسيتها للسماح الكشف عن الحذف الكروموسومات صغيرة مثل 3 ميجا بايت. في دراسة أجريت على المرضى الذين يعانون من صعوبات في التعلم وخلل البنية؛ شوهة، أظهرت 10٪ الحذف صغيرة أو الازدواجية التي كانت كشفها بواسطة هذه الطريقة ولكن التي لم يتم التعرف على G النطاقات النمط النووي. 4
ميكروأري مقرها التهجين الجينومي المقارن (صفيف [ك]) 6 والعديد من المزايا المحتملة على الطرق الأخرى المتاحة حاليا للتحقيق من الأطفال الذين يعانون من صعوبات التعلم وخلل البنية؛ شوهة. ويقدم تحليل الجينوم على نطاق السريع بدقة عالية والمعلومات التي يقدمها يرتبط مباشرة إلى خرائط الفيزيائية والوراثية للجينوم البشري.
وقد استخدمت مجموعة، [ك] بنجاح لتحليل عينات الأورام وخطوط الخلايا 7- 12 وللتحليل عالية الدقة من تشوهات الدستورية التي تتكون من المكاسب نسخة واحدة والخسائر في المناطق الكروموسومي، 13- 15 التيلوميرات، 16 وكروموسوم كامل. 17 وقد ذكرت دراسة استخدام الجينوم على نطاق صفيف CGH للتحقيق في المرضى الذين يعانون من خلل البنية؛ شوهة والعجز عن التعلم في الآونة الأخيرة. 18 وفي تلك الدراسة، خمسة عدد النسخ التغيرات اثنان منها فقط كانت دي نوفو واحد ينطوي على إعادة ترتيب داخل telomeric المنطقة كانت وجدت في 20 مريضا، وإعطاء محصول التشخيص المحتمل لل15٪.
لقد ذكرت سابقا تصميم واستخدام ميكروأرس الحمض النووي للكشف عن عدد النسخ يتغير 10 مع تطبيق لخلل وراثي خلوي، 19 واستخدمت نسخة معدلة من هذه التقنية لتحديد نقاط التوقف في الأشخاص الذين يعانون نقل المواقع متبادلة متوازنة. 20 ونحن هنا تقرير تطبيق على نطاق الجينوم صفيف [ك] في 1 ميغابيت لدراسة 50 مريضا مع العجز عن التعلم وخلل البنية؛ شوهة الذين، في معظم الحالات، قد استبعدت إعادة ترتيب telomeric.